صندوق حمایت از بیماری‌های خاص، صعب‌العلاج و نادر از ابتدای تاسیس خدمات مهم و تاثیرگذاری را به بیماران مبتلا ارایه داده است. از جمله خدمات مورد نظر می‌توان به بهره‌مندی بیش از ۱۳۰ گروه بیماری در سرفصل‌های دارو، ویزیت، خدمات پاراکلینیک (آزمایشگاه، پرتوپزشکی و توان‌بخشی)، تجهیزات پزشکی و خدمات بستری اشاره کرد.

همچنین از مزایای صندوق، تدوین بسته ابلاغی برای ۶۹ گروه بیماری با سقف تعدادی خدمات در سال از سوی وزارت بهداشت و تفاوت در پرداخت از جیب بیماران در خدمات مشمول بسته‌های خدمتی از صفر تا ۲۰% بر اساس نوع مالکیت مرکز ارائه‌دهنده و نوع خدمت دریافتی است.

بنابر اعلام مرکز امور مشتریان و اطلاع رسانی سازمان بیمه سلامت ایران، قبل از تأسیس صندوق بیماری‌های خاص و صعب العلاج برای بیماران هموفیلی برخی خدمات رایگان بوده که شامل داروهای تخصصی این بیماران (برابر فهرست ابلاغی)، فیلترخون، تزریق فاکتور، هزینه انجام تزریق فسفر و ریفامپیسین داخل مفصلی، تزریق خون و فرآورده‌های خونی، یکسری از آزمایشات مرتبط با بیماری و عوارض تزریق خون، هزینه آزمایش ژنتیک تشخیص پیش از تولد هموفیلی، تعویض مفصل بیماران هموفیلی و نمونه‌برداری از پرزهای کوریونی جفت است.

اما علاوه بر حمایت‌های فوق با تشکیل صندوق بیماری‌های خاص و صعب العلاج بیماران دارای هموفیلی نشان‌دار شده می‌توانند از مزایای صندوق بهره‌مند شوند.